| Код НЭИКОН | Коллекция | Организация | Нояб. 2009 | Дек. 2009 | Всего 2009 |
| 185 | Full Collection | Санкт-Петербургский государственный университет | 558 | 637 | 5985 |
| 4237 | Full Collection | Научная библиотека МГУ им. Ломоносова | 935 | 434 | 4768 |
| 657 | Full Collection | Томский государственный университет | 484 | 129 | 2682 |
| 2483 | STM Collection | Иркутский научный центр СО РАН | 220 | 160 | 2677 |
| 274 | Full Collection | Государственный университет - Высшая школа экономики | 256 | 293 | 2460 |
| 2632 | STM Collection | Казанский научный центр РАН | 133 | 163 | 2077 |
| 2565 | STM Collection | Институт биоорганической химии им. академиков М.М.Шемякина и Ю.А.Овчинникова РАН | 139 | 161 | 1789 |
| 2683 | Biomedical Coll. | Институт теоретической и экспериментальной биофизики РАН | 220 | 124 | 1569 |
| 2511 | STM Collection | Библиотека по естественным наукам РАН | 195 | 179 | 1555 |
| 156 | Full Collection | Российская государственная библиотека | 95 | 122 | 1418 |
| 494 | STM Collection | Уфимский государственный авиационный технический университет | 281 | 46 | 1319 |
| 724 | Biomedical Coll. | Биолого-почвенный институт ДВО РАН | 121 | 47 | 1272 |
| 5901 | Biomedical Coll. | Институт общей генетики им. Н.И.Вавилова РАН | 86 | 136 | 1032 |
| 226 | Full Collection | Сургутский государственный университет Ханты-Мансийского автономного округа - Югры | 61 | 40 | 991 |
| 449 | Full Collection | Воронежский государственный университет | 73 | 66 | 856 |
| 336 | Full Collection | Зональная научная библиотека им. В.А.Артисевич Саратовского госуниверситета | 32 | 66 | 846 |
| 963 | Full Collection | Российский государственный педагогический университет им. А.И.Герцена | 1 | 9 | 812 |
| 2567 | Biomedical Coll. | Институт белка РАН | 40 | 21 | 784 |
| 201 | MED Collection | Красноярский государственный медицинский университет имени профессора В.Ф. Войно-Ясенецкого Министерства здравоохранения и социального развития Российской Федерации | 174 | 0 | 715 |
| 450 | STM Collection | Институт химической физики им. Н.Н.Семенова РАН | 69 | 107 | 714 |
| 269 | Full Collection | Свердловская областная универсальная научная библиотека им. В.Г.Белинского | 67 | 57 | 659 |
| 313 | Biomedical Coll. | Московский государственный институт международных отношений (университет) Министерства иностранных дел Российской Федерации | 132 | 42 | 627 |
| 6722 | Full Collection | Сибирский федеральный университет | 111 | 55 | 604 |
| 2350 | Full Collection | Вятский государственный университет | 6 | 23 | 533 |
| 2591 | STM Collection | Красноярский научный центр Сибирского отделения РАН | 34 | 62 | 524 |
| 2715 | Biomedical Coll. | Институт клеточного и внутриклеточного симбиоза Уральского отделения Российской академии наук | 20 | 14 | 521 |
| 271 | Full Collection | Уральский государственный университет им. А.М.Горького | 16 | 19 | 507 |
| 2812 | Biomedical Coll. | Институт биохимии и физиологии микроорганизмов РАН | 55 | 41 | 493 |
| 2547 | Math./Computing C. | Институт вычислительного моделирования Сибирского отделения Российской академии наук | 32 | 58 | 493 |
| 2571 | STM Collection | Государственная публичная научно-техническая библиотека России | 48 | 16 | 490 |
| 1262 | Biomedical Coll. | Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии "Вектор" Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека | 8 | 14 | 484 |
| 223 | Full Collection | Южный федеральный университет | 70 | 0 | 472 |
| 373 | Full Collection | Петрозаводский государственный университет | 34 | 72 | 444 |
| 2301 | Biomedical Coll. | Финансовая академия при Правительстве Российской Федерации | 79 | 93 | 436 |
| 856 | Full Collection | Российский университет дружбы народов | 81 | 115 | 426 |
| 497 | Full Collection | Нижегородский государственный университет им. Н.И. Лобачевского | 33 | 36 | 396 |
| 2556 | STM Collection | Институт математических проблем биологии РАН | 99 | 15 | 386 |
| 2709 | LIFE Science C. | Институт экспериментальной минералогии РАН | 27 | 24 | 352 |
| 981 | STM Collection | Томский политехнический университет | 87 | 64 | 330 |
| 801 | Full Collection | Мурманская государственная областная универсальная научная библиотека | 40 | 121 | 318 |
| 285 | Full Collection | Донская государственная публичная библиотека | 22 | 33 | 316 |
| 2745 | STM Collection | Научно-исследовательский институт комплексных испытаний оптико-электронных приборов и систем | 0 | 0 | 310 |
| 982 | Full Collection | Национальная библиотека Республики Карелия | 7 | 1 | 305 |
| 254 | Full Collection | Алтайская краевая универсальная научная библиотека им. В.Я.Шишкова | 59 | 79 | 301 |
| 2843 | MED Collection | Институт физиологии им. И.П.Павлова РАН | 11 | 14 | 290 |
| 359 | LIFE Science C. | Институт вулканологии и сейсмологии ДВО РАН | 17 | 27 | 241 |
| 361 | MED Collection | Санкт-Петербургская медицинская академия последипломного образования Федерального агентства по здравоохранению и социальному развитию | 26 | 4 | 236 |
| 2840 | LIFE Science C. | Институт биологии внутренних вод им. И.Д.Папанина РАН | 19 | 53 | 233 |
| 2520 | STM Collection | Институт проблем химической физики РАН | 17 | 18 | 226 |
| 2880 | Full Collection | Пермский государственный университет | 30 | 2 | 207 |
| 1258 | STM Collection | Московский государственный технический университет им. Н.Э.Баумана | 27 | 21 | 204 |
| 369 | HSS Collection | Европейский Университет в Санкт-Петербурге (Институт) | 41 | 24 | 192 |
| 241 | STM Collection | Всероссийский институт научной и технической информации РАН | 38 | 11 | 187 |
| 618 | STM Collection | НИЯУ МИФИ | 14 | 19 | 175 |
| 2819 | Biomedical Coll. | Институт цитологии РАН | 0 | 174 | 174 |
| 2412 | STM Collection | Институт органической химии им. Н.Д. Зелинского РАН | 17 | 21 | 167 |
| 415 | Full Collection | ЦГПБ им. В.В.Маяковского | 0 | 28 | 155 |
| 2347 | STM Collection | Южный научный центр РАН | 5 | 4 | 108 |
| 5767 | Biomedical Coll. | Институт молекулярной генетики РАН | 21 | 5 | 88 |
| 785 | Full Collection | Казанский государственный университет им. В.И.Ульянова-Ленина | 3 | 16 | 43 |
| 530 | STM Collection | Московский энергетический институт (технический университет) | 3 | 2 | 35 |
| 267 | LIFE Science C. | Институт тектоники и геофизики им. Ю.А.Косыгина ДВО РАН | 1 | 1 | 20 |
| 2685 | Math./Computing C. | Институт математики им. С.Л.Соболева Сибирского отделения Российской Академии наук | 0 | 8 | 8 |
| 573 | Biomedical Coll. | Институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН | 0 | 0 | 0 |
| 6055 | LAW Collection | Московская государственная юридическая академия | 0 | ||
| Всего НЭИКОН | 5374 | 4153 | 47577 |