| Код НЭИКОН | Организация | Март 2011 | Апр. 2011 | Всего 2011 |
| 4237 | Научная библиотека МГУ им. Ломоносова | 1034 | 863 | 3549 |
| 274 | Государственный университет - Высшая школа экономики | 559 | 515 | 1952 |
| 185 | Санкт-Петербургский государственный университет | 360 | 452 | 1411 |
| 573 | Институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН | 308 | 265 | 1159 |
| 2483 | Иркутский научный центр СО РАН | 182 | 413 | 1064 |
| 785 | Казанский государственный университет им. В.И.Ульянова-Ленина | 98 | 436 | 781 |
| 6055 | Московская государственная юридическая академия | 8 | 339 | 633 |
| 657 | Томский государственный университет | 118 | 192 | 628 |
| 2511 | Библиотека по естественным наукам РАН | 120 | 216 | 613 |
| 285 | Донская государственная публичная библиотека | 229 | 127 | 613 |
| 2632 | Казанский научный центр РАН | 82 | 113 | 568 |
| 156 | Российская государственная библиотека | 60 | 89 | 385 |
| 5901 | Институт общей генетики им. Н.И.Вавилова РАН | 96 | 91 | 332 |
| 19281 | Уральский федеральный университет имени первого Президента России Б.Н.Ельцина | 78 | 110 | 320 |
| 449 | Воронежский государственный университет | 46 | 116 | 289 |
| 16811 | Федеральный Центр сердца, крови и эндокринологии им. В.А.Алмазова Федерального агентства по высокотехнологичной медицинской помощи | 93 | 0 | 267 |
| 1865 | Научно-исследовательский институт физико-химической медицины, Федеральное медико-биологическое агентство России | 76 | 74 | 266 |
| 269 | Свердловская областная универсальная научная библиотека им. В.Г.Белинского | 97 | 32 | 261 |
| 2819 | Институт цитологии РАН | 69 | 77 | 255 |
| 2683 | Институт теоретической и экспериментальной биофизики РАН | 70 | 57 | 248 |
| 450 | Институт химической физики им. Н.Н.Семенова РАН | 70 | 53 | 246 |
| 856 | Российский университет дружбы народов | 42 | 65 | 238 |
| 336 | Зональная научная библиотека им. В.А.Артисевич Саратовского госуниверситета | 36 | 109 | 236 |
| 1258 | Московский государственный технический университет им. Н.Э.Баумана | 140 | 36 | 218 |
| 369 | Европейский Университет в Санкт-Петербурге (Институт) | 94 | 25 | 207 |
| 2840 | Институт биологии внутренних вод им. И.Д.Папанина РАН | 57 | 30 | 197 |
| 2301 | Финансовая академия при Правительстве Российской Федерации | 69 | 58 | 196 |
| 494 | Уфимский государственный авиационный технический университет | 19 | 56 | 186 |
| 373 | Петрозаводский государственный университет | 54 | 84 | 183 |
| 313 | Московский государственный институт международных отношений (университет) Министерства иностранных дел Российской Федерации | 20 | 126 | 178 |
| 2567 | Институт белка РАН | 60 | 85 | 175 |
| 2880 | Пермский государственный университет | 40 | 42 | 164 |
| 724 | Биолого-почвенный институт ДВО РАН | 39 | 41 | 156 |
| 223 | Южный федеральный университет | 26 | 47 | 155 |
| 981 | Томский политехнический университет | 77 | 54 | 154 |
| 2715 | Институт клеточного и внутриклеточного симбиоза Уральского отделения Российской академии наук | 29 | 31 | 153 |
| 333 | Алтайский государственный университет | 130 | 1 | 148 |
| 2412 | Институт органической химии им. Н.Д. Зелинского РАН | 48 | 50 | 135 |
| 2350 | Вятский государственный университет | 35 | 47 | 116 |
| 241 | Всероссийский институт научной и технической информации РАН | 81 | 10 | 104 |
| 2547 | Институт вычислительного моделирования Сибирского отделения Российской академии наук | 35 | 4 | 94 |
| 2709 | Институт экспериментальной минералогии РАН | 12 | 51 | 91 |
| 801 | Мурманская государственная областная универсальная научная библиотека | 7 | 36 | 90 |
| 2812 | Институт биохимии и физиологии микроорганизмов РАН | 16 | 34 | 87 |
| 359 | Институт вулканологии и сейсмологии ДВО РАН | 9 | 18 | 85 |
| 6722 | Сибирский федеральный университет | 0 | 50 | 82 |
| 2571 | Государственная публичная научно-техническая библиотека России | 12 | 46 | 80 |
| 982 | Национальная библиотека Республики Карелия | 0 | 28 | 75 |
| 2556 | Институт математических проблем биологии РАН | 2 | 30 | 68 |
| 201 | Красноярский государственный медицинский университет имени профессора В.Ф. Войно-Ясенецкого Министерства здравоохранения и социального развития Российской Федерации | no data | no data | 65 |
| 2843 | Институт физиологии им. И.П.Павлова РАН | 13 | 16 | 62 |
| 2516 | Институт химической кинетики и горения Сибирского отделения Российской академии наук | 11 | 34 | 59 |
| 254 | Алтайская краевая универсальная научная библиотека им. В.Я.Шишкова | 4 | 18 | 55 |
| 2520 | Институт проблем химической физики РАН | 19 | 13 | 53 |
| 2565 | Институт биоорганической химии им. академиков М.М.Шемякина и Ю.А.Овчинникова РАН | 11 | 24 | 49 |
| 618 | НИЯУ МИФИ | 5 | 17 | 44 |
| 497 | Нижегородский государственный университет им. Н.И. Лобачевского | 6 | 29 | 35 |
| 634 | Кемеровский государственный университет | 6 | 11 | 32 |
| 361 | Санкт-Петербургская медицинская академия последипломного образования Федерального агентства по здравоохранению и социальному развитию | 8 | 8 | 26 |
| 13588 | Научная педагогическая библиотека им. К.Д.Ушинского | 0 | 0 | 25 |
| 2591 | Красноярский научный центр Сибирского отделения РАН | 9 | 4 | 13 |
| 451 | Институт "Московская высшая школа социальных и экономических наук" | 7 | 4 | 11 |
| 2924 | Российский кардиологический научно-производственный комплекс Росздрава | no data | no data | 0 |
| 4160 | Институт кристаллографии им. А.В.Шубникова РАН | no data | no data | 0 |
| 5973 | Кузбасский государственный технический университет | no data | no data | 0 |
| Всего НЭИКОН | 5230 | 6214 | 20798 |