| Код НЭИКОН | Организация | Июль 2011 | Авг. 2011 | Всего 2011 |
| 4237 | Научная библиотека МГУ им. Ломоносова | 460 | 426 | 6059 |
| 274 | Государственный университет - Высшая школа экономики | 223 | 107 | 3405 |
| 185 | Санкт-Петербургский государственный университет | 184 | 172 | 2545 |
| 573 | Институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН | 201 | 253 | 2231 |
| 2483 | Иркутский научный центр СО РАН | 156 | 155 | 2005 |
| 2924 | Российский кардиологический научно-производственный комплекс Росздрава | 145 | 138 | 1353 |
| 2511 | Библиотека по естественным наукам РАН | 96 | 373 | 1351 |
| 657 | Томский государственный университет | 110 | 163 | 1197 |
| 6055 | Московская государственная юридическая академия | 22 | 0 | 1131 |
| 19281 | Уральский федеральный университет имени первого Президента России Б.Н.Ельцина | 66 | 316 | 1068 |
| 2632 | Казанский научный центр РАН | 56 | 58 | 930 |
| 285 | Донская государственная публичная библиотека | 23 | 15 | 906 |
| 156 | Российская государственная библиотека | 88 | 56 | 734 |
| 5901 | Институт общей генетики им. Н.И.Вавилова РАН | 110 | 94 | 719 |
| 2819 | Институт цитологии РАН | 81 | 128 | 639 |
| 2571 | Государственная публичная научно-техническая библиотека России | 275 | 121 | 622 |
| 785 | Казанский государственный университет им. В.И.Ульянова-Ленина | 19 | 63 | 588 |
| 16811 | Федеральный Центр сердца, крови и эндокринологии им. В.А.Алмазова Федерального агентства по высокотехнологичной медицинской помощи | 185 | 176 | 588 |
| 1865 | Научно-исследовательский институт физико-химической медицины, Федеральное медико-биологическое агентство России | 46 | 43 | 496 |
| 494 | Уфимский государственный авиационный технический университет | 43 | 14 | 493 |
| 450 | Институт химической физики им. Н.Н.Семенова РАН | 48 | 40 | 437 |
| 449 | Воронежский государственный университет | 24 | 13 | 432 |
| 856 | Российский университет дружбы народов | 24 | 13 | 432 |
| 369 | Европейский Университет в Санкт-Петербурге (Институт) | 97 | 62 | 423 |
| 269 | Свердловская областная универсальная научная библиотека им. В.Г.Белинского | 56 | 33 | 412 |
| 2683 | Институт теоретической и экспериментальной биофизики РАН | 37 | 24 | 401 |
| 2840 | Институт биологии внутренних вод им. И.Д.Папанина РАН | 30 | 72 | 400 |
| 2301 | Финансовая академия при Правительстве Российской Федерации | 0 | 50 | 377 |
| 724 | Биолого-почвенный институт ДВО РАН | 63 | 47 | 361 |
| 336 | Зональная научная библиотека им. В.А.Артисевич Саратовского госуниверситета | 22 | 9 | 319 |
| 2715 | Институт клеточного и внутриклеточного симбиоза Уральского отделения Российской академии наук | 46 | 34 | 313 |
| 6722 | Сибирский федеральный университет | 67 | 51 | 310 |
| 2567 | Институт белка РАН | 19 | 25 | 305 |
| 313 | Московский государственный институт международных отношений (университет) Министерства иностранных дел Российской Федерации | 1 | 2 | 295 |
| 1258 | Московский государственный технический университет им. Н.Э.Баумана | 4 | 0 | 280 |
| 373 | Петрозаводский государственный университет | 19 | 9 | 268 |
| 223 | Южный федеральный университет | 10 | 16 | 261 |
| 2565 | Институт биоорганической химии им. академиков М.М.Шемякина и Ю.А.Овчинникова РАН | 4 | 190 | 261 |
| 981 | Томский политехнический университет | 12 | 11 | 247 |
| 2880 | Пермский государственный университет | 8 | 2 | 246 |
| 801 | Мурманская государственная областная универсальная научная библиотека | 89 | 1 | 229 |
| 2412 | Институт органической химии им. Н.Д. Зелинского РАН | 14 | 28 | 225 |
| 241 | Всероссийский институт научной и технической информации РАН | 20 | 18 | 218 |
| 2709 | Институт экспериментальной минералогии РАН | 30 | 47 | 203 |
| 2547 | Институт вычислительного моделирования Сибирского отделения Российской академии наук | 28 | 15 | 182 |
| 497 | Нижегородский государственный университет им. Н.И. Лобачевского | 22 | 9 | 176 |
| 2556 | Институт математических проблем биологии РАН | 11 | 57 | 174 |
| 333 | Алтайский государственный университет | 0 | 0 | 161 |
| 359 | Институт вулканологии и сейсмологии ДВО РАН | 15 | 13 | 161 |
| 2350 | Вятский государственный университет | 2 | 0 | 144 |
| 618 | НИЯУ МИФИ | 30 | 7 | 136 |
| 634 | Кемеровский государственный университет | 76 | 1 | 124 |
| 2812 | Институт биохимии и физиологии микроорганизмов РАН | 10 | 2 | 107 |
| 254 | Алтайская краевая универсальная научная библиотека им. В.Я.Шишкова | 0 | 5 | 94 |
| 2843 | Институт физиологии им. И.П.Павлова РАН | 12 | 5 | 91 |
| 2520 | Институт проблем химической физики РАН | 11 | 0 | 90 |
| 982 | Национальная библиотека Республики Карелия | 0 | 0 | 81 |
| 361 | Санкт-Петербургская медицинская академия последипломного образования Федерального агентства по здравоохранению и социальному развитию | 46 | 0 | 81 |
| 2516 | Институт химической кинетики и горения Сибирского отделения Российской академии наук | 10 | 13 | 71 |
| 4160 | Институт кристаллографии им. А.В.Шубникова РАН | 0 | 4 | 41 |
| 451 | Институт "Московская высшая школа социальных и экономических наук" | 11 | 1 | 32 |
| 13588 | Научная педагогическая библиотека им. К.Д.Ушинского | 0 | 0 | 25 |
| 2591 | Красноярский научный центр Сибирского отделения РАН | 0 | 0 | 14 |
| 5973 | Кузбасский государственный технический университет | 0 | 0 | 2 |
| 201 | Красноярский государственный медицинский университет имени профессора В.Ф. Войно-Ясенецкого Министерства здравоохранения и социального развития Российской Федерации | 0 | 0 | 0 |
| Всего НЭИКОН | 3617 | 3800 | 38702 |