| Код НЭИКОН | Организация | Нояб. 2012 | Дек. 2012 | Весь пописной период |
| 385 | Новосибирский государственный технический университет | 1799 | 339 | 2138 |
| 274 | Национальный исследовательский университет "Высшая школа экономики" | 671 | 930 | 1601 |
| 4237 | Научная библиотека Московского государственного университета имени М.В. Ломоносова | 649 | 571 | 1220 |
| 356 | Научный центр акушерства, гинекологии и перинатологии имени академика В.И. Кулакова" Министерства здравоохранения Российской Федерации | 147 | 726 | 873 |
| 185 | Санкт-Петербургский государственный университет | 426 | 348 | 774 |
| 16811 | Федеральный Центр сердца, крови и эндокринологии им. В.А. Алмазова Министерства здравоохранения Российской Федерации | 382 | 250 | 632 |
| 785 | Казанский (Приволжский) федеральный университет | 74 | 445 | 519 |
| 313 | Московский государственный институт международных отношений (университет) Министерства иностранных дел Российской Федерации | 75 | 443 | 518 |
| 2924 | Российский кардиологический научно-производственный комплекс Министерство здравоохранения и социального развития Российской Федерации | 281 | 137 | 418 |
| 2483 | Иркутский научный центр Сибирского отделения Российской академии наук | 229 | 152 | 381 |
| 657 | Национальный исследовательский Томский государственный университет | 263 | 85 | 348 |
| 156 | Российская государственная библиотека | 49 | 219 | 268 |
| 6055 | Московская государственная юридическая академия имени О.Е. Кутафина | 170 | 55 | 225 |
| 285 | Донская государственная публичная библиотека | 85 | 139 | 224 |
| 2511 | Библиотека по естественным наукам Российской академии наук | 105 | 110 | 215 |
| 2794 | Физический институт им. П.Н.Лебедева Российской академии наук | 118 | 93 | 211 |
| 403 | Библиотека Российской академии наук (БАН) | 62 | 144 | 206 |
| 856 | Российский университет дружбы народов | 116 | 84 | 200 |
| 5901 | Институт общей генетики им. Н.И.Вавилова Российской академии наук | 63 | 133 | 196 |
| 23073 | Центр по проблемам экологии и продуктивности лесов Российской академии наук | 1 | 150 | 151 |
| 369 | Европейский Университет в Санкт-Петербурге | 84 | 65 | 149 |
| 429 | Всероссийская государственная библиотека иностранной литературы им. М.И. Рудомино | 85 | 64 | 149 |
| 1865 | Научно-исследовательский институт физико-химической медицины Федерального медико-биологического агентства | 83 | 66 | 149 |
| 223 | Южный федеральный университет | 24 | 95 | 119 |
| 201 | Красноярский государственный медицинский университет имени профессора В.Ф. Войно-Ясенецкого Министерства здравоохранения Российской Федерации | 46 | 72 | 118 |
| 494 | Уфимский государственный авиационный технический университет | 67 | 38 | 105 |
| 2792 | Институт леса им. В.Н.Сукачева СО РАН | 49 | 53 | 102 |
| 801 | Мурманская государственная областная универсальная научная библиотека | 46 | 50 | 96 |
| 6722 | Сибирский федеральный университет | 58 | 29 | 87 |
| 22765 | Санкт-Петербургский академический университет - научно-образовательный центр нанотехнологий Российской академии наук | 17 | 66 | 83 |
| 19281 | Уральский федеральный университет имени первого Президента России Б.Н.Ельцина | 55 | 22 | 77 |
| 557 | Северный (Арктический) федеральный университет имени М.В.Ломоносова | 51 | 13 | 64 |
| 2571 | Государственная публичная научно-техническая библиотека России | 49 | 12 | 61 |
| 269 | Свердловская областная универсальная научная библиотека им. В.Г.Белинского | 53 | 7 | 60 |
| 1258 | Московский государственный технический университет им. Н.Э.Баумана | 28 | 21 | 49 |
| 724 | Биолого-почвенный институт Дальневосточного отделения Российской академии наук | 24 | 25 | 49 |
| 981 | Национальный исследовательский Томский политехнический университет | 35 | 14 | 49 |
| 625 | Белгородский государственный национальный исследовательский университет | 6 | 42 | 48 |
| 2692 | Физико-технический институт им. А.Ф. Иоффе РАН | 17 | 14 | 31 |
| 236 | Центральная научная библиотека Дальневосточного отделения Российской академии наук | 16 | 15 | 31 |
| 2301 | Финансовый университет при Правительстве Российской Федерации | 8 | 22 | 30 |
| 618 | Национальный исследовательский ядерный университет "МИФИ" | 20 | 10 | 30 |
| 2279 | Пермский национальный исследовательский политехнический университет | 22 | 6 | 28 |
| 2862 | Российский Федеральный ядерный центр - Всероссийский научно-исследовательский институт экспериментальной физики (РФЯЦ-ВНИИЭФ) | 3 | 25 | 28 |
| 31198 | Якутский научный центр Сибирского отделения Российской академии наук | 0 | 27 | 27 |
| 2843 | Институт физиологии им. И.П. Павлова РАН | 1 | 21 | 22 |
| 17934 | Национальная библиотека Республики Саха (Якутия) | 0 | 21 | 21 |
| 894 | Балтийский федеральный университет им. И.Канта | 14 | 6 | 20 |
| 963 | Российский государственный педагогический университет им. А. И. Герцена | 2 | 13 | 15 |
| 316 | Институт научной информации по общественным наукам РАН | 0 | 12 | 12 |
| 1468 | Российская академия народного хозяйства и государственной службы при Президенте Российской Федерации | 3 | 9 | 12 |
| 952 | Российский государственный гуманитарный университет | 8 | 2 | 10 |
| 788 | Государственная публичная научно-техническая библиотека Сибирского отделения РАН | 5 | 5 | 10 |
| 340 | Удмуртский государственный университет | 2 | 6 | 8 |
| 241 | Всероссийский институт научной и технической информации Российской академии наук | 4 | 2 | 6 |
| 6704 | Восточно-Сибирский государственный университет технологий и управления | 4 | 0 | 4 |
| 395 | Кемеровская областная научная библиотека им. В.Д.Федорова | 2 | 1 | 3 |
| 2632 | Казанский научный центр РАН | 2 | 1 | 3 |
| 850 | Новосибирский национальный исследовательский государственный университет | 1 | 0 | 1 |
| 2062 | Самарский государственный университет | 0 | 1 | 1 |
| 480 | Российская национальная библиотека | 0 | 0 | 0 |
| 26410 | Институт экологии растений и животных УрО РАН | 0 | 0 | 0 |
| 2412 | Институт органической химии им.Н.Д.Зелинского Российской академии наук | 0 | 0 | 0 |
| 1262 | Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии "Вектор" | 0 | 0 | 0 |
| Всего НЭИКОН | 6759 | 6526 | 13285 |